Le Conseil d'administration est composé d’un administrateur pour chaque Etat membre.

Il prend les mesures nécessaires au fonctionnement de l'Agence et peut proposer au Comité des ministres toutes les mesures pouvant concourir à l'élaboration de la politique générale de l'Agence.

Il se réunit en session ordinaire au moins deux fois l'an :

 • Session de juillet/août :

• analyse l’activité de l’Agence relative à la gestion de la sécurité et à la qualité des services rendus;
• examine les états financiers et arrête les comptes au 31 décembre de l’exercice écoulé;
• prépare la réunion du Comité des Ministres de tutelle.

 • Session de décembre :

• analyse l’activité de l’Agence relative à la gestion de la sécurité et à la qualité des services rendus;
• examine le budget de l’année à venir;

D'autres réunions du Conseil sont organisées lorsque les besoins de l'Agence l'exigent.

Le président est nommé, après accord du Comité des ministres, par le Conseil d'administration parmi ses membres.

Son mandat est de trois ans, renouvelable une seule fois.

La présidence est assurée depuis le 1er mai 2023 par M. Rolland Fidiariseheno RANJATOELINA (Madagascar).

Le directeur général est nommé par le Conseil d’administration après désignation par le Comité des ministres pour une durée de quatre(4) ans, renouvelable une fois.

Il assure la gestion de l'Agence en exécution des décisions prises par les deux instances statutaires précitées;

• Recrute tout le personnel de l'Agence à l'exception de l'Agent Comptable et du Contrôleur Financier;

• Est responsable de la gestion administrative de l'Agence.
  

• Nomme dans chaque Etat membre un "Représentant", responsable des activités de l'Agence dans son Etat d'affectation.

Le Directeur Général est assisté dans l'exécution de sa mission par six (6) Directeurs.

Le Directeur Général

Prosper ZO'O MINTO

Comité de direction 

Joachim Tchissambou Mbondou

 Directeur de Cabinet du Directeur général

Sidi Koné 

Directeur de l'Exploitation de la Navigation Aérienne

Arouna Rahimi Touré

Directeur Technique

Mamadou TALL

Directeur des Ressources Humaines

Mohamed Yattara

Directeur des Contrôles Internes et des Systèmes de Gestion SSQE

Louis Prince Agbodjan

Directeur des Ressources Financières et du Budget

Constitué des ministres en charge de l'aviation civile des Etats parties, c’est l'organe suprême de l'Agence.

Il se réunit au moins une fois l'an en session ordinaire avant le 31 juillet de l'année civile sauf décision contraire du Président du Comité des Ministres.

Il définit la politique générale de l'Agence, et notamment sa stratégie, et s'assure de sa mise en œuvre.

A ce titre, il est notamment chargé:

• de veiller au respect des exigences de sécurité des services fournis par l'Agence ;
• de définir sa politique tarifaire;
• d'examiner et d'approuver ses plans pluriannuels ;
• de désigner le directeur général de l'Agence dans les conditions définies par les statuts annexés à la Convention.

Il se prononce sur les demandes d'adhésion à la Convention.

La présidence est tournante, à un rythme annuel. 

Elle est assurée actuellement par Madame Fatima Goukouni Weddeye, Ministre en charge de l’Aviation Civile du Tchad.